清洁消化道，提高消化吸收能力，治愈胃肠道疾病。
医学上所谓的“食物自身慢性中毒”是指，食物残渣在肠腔内停留时间过长，经肠道菌群发酵使腐败物质增加，以致大量毒素被肠道重吸收，引起机体中毒，出现头痛、头晕、便秘、高血压或精神衰弱等全身中毒症状。
要想祛病健身，首先要把积于肠道的宿便清除。但宿便却不是靠灌肠或服泻药可以清除尽的，唯有进行“辟谷”，做一次“大扫除”，使肠道彻底“清仓”才有疗效。同时，在辟谷过程中，消化道壁上的衰老或机能不健全的细胞也会脱落而随宿便排出，消化道内壁上的脂肪成分亦会分解。当进食后，消化道内壁上机能旺盛的细胞相对增多，肠胃机能进一步增强，使整个消化系统的机能状态得以改善，工作效率进一步提高。这样不仅能避免“食物自身慢性中毒”现象，而且由此而引发的疾病也会自然痊愈，身体会日趋强壮。
分解消耗多余的脂肪，减肥、美体养生。
过度肥胖，不仅影响躯体活动和形体美，而且容易引发许多疾病，如高血压、冠心病、糖尿病、脂肪肝、腰椎病等。辟谷可使机体多余脂肪分解，供给机体利用。
由于辟谷的刺激，机体的调节功能能进一步加强，代谢活动亦得到改善，脂肪的合成代谢与分解代谢趋于动态平稀，最终彻底根除肥胖症及因此引起的继发症状，从而达到减肥降脂、美体养生的作用。
疏通和软化血管，改善血管栓塞和硬化。
随着年龄增长及高血压等疾病的出现，人体血管内膜的完整性时而受到破坏。动脉内膜损伤后，血小板在损伤处聚集，形成微血栓阻塞血管。同时，动脉壁对从血浆侵入的脂质发生反应而形成粥样斑块，导致血管进一步狭窄。
辟谷后，物质的分解代谢加快，促进物质分解的酶类的分解作用加强，在脂肪动员的同时，血管腔内的血栓也会被溶解，而使血流畅通，沉积于动脉内膜下的脂质也会分解析出，使动脉管壁得到软化。故辟谷能有效地疏通和软化血管，避免血管栓塞和硬化所导致的心血管疾病。
清除体内有毒物质，净化内环境。
经常运转的机器，需要经常清洁才能延长使用寿命。人体需要经常不断的排除积蓄的有害物质，才能保持机体细胞的活力。在新陈代谢过程中人体通过呼吸和消化系统吸收氧气和营养物质，同时产生代谢废物（亦可称毒素）如尿酸、尿素、二氧化碳等。这些代谢废物通过肾，皮肤和肺等器官排出体外，虽然平时肾，皮肤和肺不断地消除废物，但是，由于营养物质的不断吸收以及代谢废物的不断产生，使排泄系统总不能完全彻底地清除代谢废物（毒素）。较为常见的例子如体液酸性物质多了就会引起人体细胞酸中毒，组织细胞水分过多就会选成水肿，血管内壁脂类积蓄多子就会导致血管硬化或堵塞等等。
人体是一部能自动修理和维护的“机器”，在辟谷的情况下，即机体在停止吸收营养素的情况下，机体通过“内耗”自净作用和排泄作用，最大限度地分解和排出体内积蓄的有害物质，从而达到治病健身的目的。
辟谷不仅于对体内有害物质有清理作用，本身就是对细胞的一种良性刺激，它可刺激细胞恢复正常代谢，提高细胞活力。在辟谷过程中，机体首先消耗的是弱化、病变、衰老的组织细胞，如脱落细胞、组织细胞附着物等。辟谷引起机体的这种废物利用过程，医学上称为“自身融解”。
辟谷引起的“自身融解”是不用手术刀的内脏手术，比外科医生做的更自然，更精神，更有效，丝毫不损于健康而可除去百病。
激活免疫系统，提高机体免疫力。
临床实验证明，辟谷一段时间后，白细胞的数量急速增加。在营养成分充足时，机能不健全或衰老的细胞不易立即死亡。但是在辟谷的情况下，机体中不健全或衰老的细胞会率先死亡而被溶解，“当再进食时，免疫器官又可进行部分细胞的重建更新，提高了免疫器官乃至免疫系统的整体功能。辟谷使机体老化的蛋白质得到更新，带来了组织细胞的更新和其机能的改善，从而使机体的整体机能得到加强，实现了人们梦寐以求的“返老还童”。
增强机体自身调节机能，使器官功能协调一致。
生理学把人体功能活动的调节机制分为三种。即神经调节、体液调节和器官、组织、细胞的自身调节，其中神经调节是人体内最重要的调节机能。辟谷可以刺激机体进行自身净化作用，改善调节系统生活的内环境，使调节机能更灵活、更完善、更精确，以保证机体各部分功能的协调统一。
刺激疏通经络，提高抵御外邪能力。
中医认为，淤血为病理产物之一，凡全身血液运行不畅或局部血液停滞，或体内存留离经之血未能消散者，都称为淤血，淤血形成后，反过来又能影响气血的运行，导致脏腑功能失调，引起许多疾病。因此，淤血既是一种病理产物，又是一种重要的病因。中医还认为，气为血之帅，气行则血行，气滞则血淤，故气滞也是致病因素之一。祖国医学对肿瘤的发病原因解释为“营卫不通”、“七情郁结”、“脾吸受伤”等，是“气血凝滞”所致。无论气滞还是血瘀，论其成因，均与经络有关，因为经络有沟通表里上下，联系脏腑器官，通行血气的作用。经络不通，则会出现气滞或血瘀。
辟谷能使机体进行自身的净化，必然也能疏通经络，消结化瘀，使经络通畅，经络被激活和疏通之后，就能充分发挥自身调节机能，协调机能协调组织细胞和脏腑之间的功能，使机体阴阳保持相对平行，抵御外邪，保持健康状态。